При выборе материнской платы нужно уделить особое внимание следующему:
Форм-фактор - определяет размеры, установочные отверстия, разъемы питания материнской платы. При выборе материнской платы нужно учитывать то, чтобы корпус компьютера поддерживал форм-фактор материнской платы.
В данный момент более распространены следующие форм-факторы:

• ATX (Advanced Technology eXtended) - один из самых распространенных форм-факторов системных плат, идеален для сборки домашнего компьютера. Материнские платы формата ATX имеют приблизительные размеры 30.5 x 24.4 см.
• mATX (micro ATX) - несколько уменьшенный стандарт ATX. Подходит для сборки офисных компьютеров, когда не требуется много слотов расширения. Материнские платы формата mATX имеют габариты 24.4 x 24.4 см.
• mini-ITX - материнские платы формата mini-ITX имеют небольшие размеры (17 х 17 см).

Чипсет (набор системной логики) - набор микросхем, обеспечивающих подключение процессора к оперативной памяти и контроллерам периферийных устройств. Современные чипсеты, как правило, состоят из двух микросхем: "Северного моста" и "Южного моста".
Северный мост (Northbridge) - отвечает за связь процессора с устройствами, использующими высокопроизводительные шины, такие как оперативная память и видеоадаптер. От него обычно зависит максимальный объём и тип (например, DDR2 или DDR3) оперативной памяти, а также пропускная способность оперативной памяти и видеоадаптера.
Южный мост (Southbridge) - отвечает за ввод/вывод и поддержку периферийных устройств (карты расширения, жесткие диски, Ethernet, звук, USB 2.0, SATA).
Сокет (socket) – гнездо, куда крепится процессор на системной плате. В настоящее время используются следующие сокеты:

• Сокеты для процессоров Intel - LGA 775 (Celeron, Pentium 4, Pentium D, Pentium Dual Core, Core 2 Duo, Core 2 Quad, Core 2 Extreme), LGA 1336 (Core i7).
• Сокеты для процессоров AMD - Socket AM2, Socket AM2+, Socket AM3 (Athlon 64x2, Athlon x2, Phenom 64x3, Phenom 64x4, Phenom II x3, Phenom II x4).

Слоты оперативной памяти - выбирая материнскую плату нужно учитывать, какой тип оперативной памяти вы собираетесь использовать DDR2 или DDR3. DDR2 невозможно вставить в разъем предназначенный для памяти DDR3 и наоборот. Некоторые производители делают материнские платы со слотами для памяти DDR2 и DDR3 на одной плате. Также важно количество слотов под оперативную память, чем больше слотов, тем больше возможностей при модернизации компьютера.
Важно, чтобы материнская плата поддерживала тактовую частоту оперативной памяти, допустим у вас память DDR2 - 1066 МГц, а вы приобретаете системную плату, поддерживающую только частоту памяти 800 МГц, то память также будет работать на частоте 800 Мгц.